MSAP

发布时间:2022-08-19浏览次数:91

甲基化敏感扩增多态性,它是在扩增片段长度多态性技术的基础上建立起来的。MSAP技术相对其他测定DNA甲基化程度技术有如下优点:

(1)不需知道被测DNA的序列信息,在不同生物上具有通用性,可用于DNA序列背景知识未知的生物。

(2)操作相对简便,在AFLP技术体系的基础上不需要太大改进,即可操作。

(3)可在全基因组范围检测CCGG位点的胞嘧啶甲基化变化。MSAP技术的局限性在于不能完成非CCGG位点的胞嘧啶甲基化。

MSAP的选择扩增产物目前主要通过两种方法进行分离检测,传统的聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)的方法和自动化程度较高的毛细管凝胶电泳(FISH)进行检测。

PAGE方法主要是优点是引物可以是普通引物,适用于少量样本或者大量样本的引物筛选比较合适,另外还可以对差异条带进行克隆测序,获得差异条带的序列信息。

毛细管电泳检测方法的优点是自动化,可以对大量样本进行实验,速度快,后期的条带读取可以依靠软件,降低了人为读取的标准不一。

1)MSAP服务内容

1 样本基因组DNA的提取

2 筛选多态性较好的引物(酶切,预扩,选择性扩增)

3-1 在ABI3730xl测序仪上完成数据采集

3-2 或是在JY-CX2B型 测序电泳槽上完成PAGE 检测(可以回收差异带)

数据分析:和客户详细沟通,确认分析方案:读取01矩阵,PAGE胶建议客户自己读取;

2)客户提供:

★ 基因组DNA:

●至少15μL样品,浓度为50-100ng/μL;

●2%琼脂糖电泳检测有DNA主带,没有降解;

●DNA经过DNA纯化试剂盒或磁珠纯化;

●DNA需溶解在TE或灭菌的去离子水里;

●DNA溶解后,肉眼看不到杂色;

★ 植物材料: 新鲜组织,叶片采用硅胶干燥后或干冰运输;

★ 动物材料: 新鲜组织,无水乙醇封存低温运输;

3)试验费用:


MSAP 毛细管电泳检测按照96个样本进行随机8对引物计算,提供01矩阵
项目单价数量金额
DNA提取30962880
引物30000
酶切401927680
预扩151922880
选择性扩增10153615360
毛细管检测8001612800
读带、分析

议价
合计

41600
MSAP PAGE电泳检测按照25个样本进行随机8对引物计算,提供PAGE胶图
项目单价数量金额
DNA提取3025750
纯化1025250
酶切40502000
预扩1550750
选择性扩增104004000
PAGE检测80086400
读带、分析

议价
合计

14150

MSAP1

MSAP2



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